Эти маленькие собаки ведут свою историю с Мексики. Позже они был введены в США, Франции и других странах мира. Одна из причин популярности породы в том, что их можно легко носить с собой. Существует большое разнообразие специальных сумок, предназначенных для этой цели. Чихуахуа, выглядывающая из сумки владельца, смотрится вполне естественно.
Считается, что «чишки» являются единственной аборигенной породы собак Северной Америки. Скульптуры животных, напоминающих чихуахуа, археологи обнаружили на местах раскопок, они датируются 5 веком н.э. В 1100 году нашей эры, коренные жители Мексики — тольтеки, занимали центральную и южную части современной территории страны. В 13-м веке, тольтеки были побеждены ацтеками. И тольтеки и ацтеки имели длинношерстных собак небольшого роста, в качестве домашних животного. Также их задействовали в религиозных обрядах. Эти собаки были известны как течичи. Есть много историй о происхождении чихуахуа. Во-первых, тольтеки и ацтеки, возможно, выбирали течичи из Перро Chihuahueno, горных собак чихуахуа. У Перро Chihuahueno была круглая голова, длинные ногти, и короткие, стоячие уши.
Еще одна версия связана с вторжением в ацтекскую империю испанских захватчиков в 16 веке. В ней говорится, что испанские захватчики принесли миниатюрных китайских собак и скрестили с течичи, что привело к возникновению чихуахуа.
В 1850 году один из родоначальников этой породы был найден в старых развалинах возле Casas Grandes в мексиканском штате Чиуауа. Эти собаки стали популярными в штатах Техас, Аризона и Нью-Мексико, а затем они были введены в Соединенных Штатах. Американский клуб собаководства признал эту породу в 1904 году. На сегодняшний день существует много гибридов и помесей с другими породами чихуахуа.